UbuntuのPythonでpyQtGraphをインストール

作業メモ
まずはUbuntuにてeasy_installをpipをインストール

easy_installのインストール
$ sudo apt-get install python-setuptools

pipのインストール
$ sudo apt-get install python-pip

pipを使ってpyQtGraphをインストール
$ sudo pip install pyqtgraph

分子動力学による粒子のシミュレーション

粒子の動きを分子動力学で計算しmatplotlibで可視化してみる。
ただし各粒子間には相互作用は働かないシンプルな系として考える。
速度の計算はベルレ法(参考)。

各粒子はお互いが見えていないので、初速のまま真っ直ぐに飛び続ける。境界を越えたら反対側へ。

実行の結果は下記。
Molecular dynamics simulation sample

オンラインでのgif圧縮

matplotlibで生成したgifをwebへアップする際に、
少しでもgifファイルサイズを小さくするため下記サイトを使ってみた。

https://compressor.io/

結果は下記。余白が多いようなgifアニメは結構圧縮が効く様子。
930KB -> 530KB

matplotlibでランダムウォーク

ランダムウォークをmatplotlibで表示してみた。
各粒子の動作は乱数で上下左右に動くように設定。
マシンが非力なせいか、粒子数を増やすとgif作成にやたら時間がかかる。

実行した結果が下記。
random work at matplotlib by python

random work sample by python and matplotlib.

cygwinでmatplotlibとscipyを使えるようにする

↓こちらのサイトを参考に、そのままの手順でできました。
http://ssmn0621.blogspot.jp/2016/03/cygwinnumpyscipymatplotlib.html

■pipのインストール
%easy_install-2.7 pip

■scipyのインストール
%pip install scipy

■matplotlibのインストール
%easy_install-2.7 matplotlib==2.0.0

■実行テスト
setenv DISPLAY :0.0 #DISPLAY設定
run xwin -multiwindow -noclipboard #xを起動
python rect.py

■実行結果
matplotlibで描画した長方形図形

■rect.pyの中身は↓

※easy_install , pip
共にpython用外部ライブラリのパッケージ管理ツール
easy_installの方が古いらしく、pipはこれらを置き換える
 目的で開発されている。